1945年日军投降投降仪式在南京举行。程慈航身负血海深仇回到故土，他知道几年前杀害心上人小玉的凶手中田等人必定在南京城内。火车站，各路人马暗流涌动，程慈航看到了拎着神秘箱子的小野，不顾一切地追了上去。此时，警察厅长莫采石下令一定要抢到那只神秘的箱子，对任何阻拦者均格杀勿论。就在程慈航快要制服小野时，警察欧阳倩和关天平赶到，小野逃跑，箱子被一双神秘的手拿走。程慈航被当作外国间谍压上卡车，带到郊外准备处死。欧阳倩觉得程慈航似乎不是奔着箱子而去，而是拿着箱子的日本人。欧阳倩等人去郊外寻找程慈航，恰巧遇到成功脱逃正在林中喝水的程慈航。程慈航被带上警车，他很好奇为何欧阳倩和小玉长得如此之像。莫采石将火车
霍然力荐莫采石的侄子程慈航来破案，莫采石再三推辞，反让严达庆来侦破此案。霍然责怪严达庆强出头。欧阳倩从刘阿常处接过了车夫杀人案，并带程慈航去了现场。程慈航到了现场，很快便知道出了凶手是谁。经过一番精彩的推理论证，凶手被抓，众人皆叹服。欧阳倩这才相信程慈航是莫采石的侄子。青铜馆被窃，严达庆让正在休假的肖主任连夜赶回来，接受调查。欧阳倩回到锦线，告诉齐掌柜可利用程慈航去找五九档案。程慈航关心五九档案的下落，他怀疑青铜馆失窃的正是五九档案。果然，在中央博物院，他找到了一些蛛丝马迹。在回家的路上，程慈航遭到两名日本特务的袭击，欧阳倩赶来帮忙。程慈航告诉欧阳倩，
莫采石希望程慈航不要插手五九档案的事情，但程慈航想通过此案找到中田，为小玉报仇雪恨。为了迫使程慈航出山，霍然故意放消息给记者，通过舆论给莫采石施压。入夜，莫采石接到电话，凤台路发生命案，肖主任夫妇被杀。程慈航来到肖家附近，被严达庆当做犯罪嫌疑人抓了起来。哈金斯上校拜访莫采石，希望中国政府能尽快找到五九档案，他希望程慈航能出山。严达庆想对程慈航严刑逼供，程慈航声称自己是日本窃贼，引来了莫采石。莫采石在狱中见到了程慈航，把严达庆臭骂了一顿。霍然给程慈航下了一张聘书，请程慈航担任独立大侦探。程慈航拒绝了任命，只想侦破五九档案。莫采石拂袖而去。霍然给程慈航办了
